利用AB SCIEX QTRAP?4500系統(tǒng)建立假羊肉的檢測(cè)方法

AB SCIEX QTRAP® 4500
首先采用高靈敏度、高掃描速度的AB SCIEX Triple TOFTM 5600質(zhì)譜系統(tǒng)鑒定各肉類的蛋白質(zhì),通過比較分析尋找各肉類物種蛋白質(zhì)特異的肽,經(jīng)過blast進(jìn)一步篩查和確認(rèn),然后再在AB SCIEX QTRAP® 4500系統(tǒng)上利用 MIDASTM工作流程建立起多重反應(yīng)監(jiān)測(cè)(MRM)檢測(cè)假羊肉的方法。主要目的是建立一套簡(jiǎn)單易用的MRM檢測(cè)假肉方法,不再需要復(fù)雜的方法開發(fā)過程,而且該方法可以很方便地將新的需要檢測(cè)物種的MRM離子對(duì)加進(jìn)去,在一個(gè)方法里可以同時(shí)檢測(cè)多個(gè)特征肽和多個(gè)物種。另外QTRAP®質(zhì)譜可以利用MRM觸發(fā)的增強(qiáng)離子掃描方式進(jìn)一步確認(rèn)蛋白質(zhì)/肽序列,從而有效去除假陽性的可能,增加檢測(cè)結(jié)果的可靠性。最終檢測(cè)方法可以利用純鴨肉或雞肉樣品來繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,從而很容易計(jì)算出樣品中摻入假肉的比例和量。所以質(zhì)譜檢測(cè)方法要比PCR、ELISA 或其他非直接檢測(cè)方法更簡(jiǎn)易、更準(zhǔn)確和更可靠。
方法
材料
本文所用的肉類樣品:鴨肉、雞肉、羊肉、牛肉、豬肉、兔肉,均從市場(chǎng)購買,摻假樣品羊肉卷是從某大型超市購買,大鼠肉來自實(shí)驗(yàn)用大鼠腿部肌肉。
樣品制備
首先取2g肉樣均質(zhì),加入液氮研磨成粉狀,然后加入蛋白提取液(7M尿素,2M硫脲,4%CHAPS),離心取0.1mL上清液并轉(zhuǎn)移到超濾管中,加入二硫蘇糖醇在60℃條件下保持60分鐘還原二硫鍵,然后加入碘乙酰胺室溫避光反應(yīng)30分鐘進(jìn)行烷基化,加入200μL50mmol/mL碳酸氫銨溶液,14000g離心20分鐘,重復(fù)3次,最后加入100μL含有胰蛋白酶的50mmol/mL碳酸氫銨溶液震蕩混勻,40℃酶解3小時(shí)。
特征肽的找尋
采用Eksigent nanoLC-Ultra®液相系統(tǒng)和AB SCIEX Triple TOFTM 5600質(zhì)譜系統(tǒng)鑒定各物種肉類蛋白質(zhì),每個(gè)樣品上樣2μg總蛋白。采用75μm內(nèi)徑柱子30分鐘梯度分析時(shí)間。用Protein PilotTM軟件進(jìn)行蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫檢索,所用數(shù)據(jù)庫是NCBInr全庫,選用了氨基酸替換搜索功能。
通過詳細(xì)比較在各個(gè)物種肉類鑒定的蛋白質(zhì)和肽列表,找到只在鴨肉或雞肉樣品里鑒定的特異肽,即這些肽可以作為鴨或雞的特異標(biāo)志物,且這些肽對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)必須是幾個(gè)物種里都能鑒定到的,只是肽的氨基酸序列有差別,并且盡量選用高豐度蛋白質(zhì)對(duì)應(yīng)的肽。最后將這些特征肽再在NCBI網(wǎng)站上進(jìn)行blast分析,進(jìn)一步確認(rèn)其特異性,即這些肽的氨基酸序列不能與其他幾個(gè)物種100%匹配。
MIDASTM工作流程建立
MRM檢測(cè)方法
采用Shimadzu 20AD XR液相系統(tǒng)和AB SCIEX QTRAP® 4500質(zhì)譜系統(tǒng)構(gòu)建MIDASTM工作流程、建立MRM檢測(cè)方法。每個(gè)肉類樣品取2μg總蛋白,經(jīng)過22分鐘的液相梯度條件分離,其中的A相為0.1%甲酸的水溶液,B相為0.1%甲酸的乙腈。色譜柱采用Phenomenex Kinetex 4.6mm×100mm,2.6um,100A反向C18色譜柱,流速0.4mL/min,40℃柱溫。
表 1 MRM檢測(cè)液相分離條件
Time(min) | A(%) | B(%) |
1 | 90 | 10 |
15 | 65 | 35 |
16 | 10 | 90 |
18 | 10 | 90 |
18.1 | 2 | 10 |
22 | 98 | 10 |
質(zhì)譜檢測(cè)是在配有電噴霧電離源(ESI)的AB SCIEX QTRAP®4500質(zhì)譜平臺(tái)上完成的。MRM觸發(fā)EPI方法是基于MIDASTM工作流程開發(fā)完成。
基本思路:首先,利用Skyline軟件構(gòu)建鴨和雞的特征肽的MRM離子對(duì)和QTRAP®的MRM觸發(fā)EPI實(shí)驗(yàn)方法。然后在7個(gè)肉類樣品中逐一進(jìn)行篩選和確認(rèn),根據(jù)同一個(gè)肽的MRM離子對(duì)的保留時(shí)間和MSMS質(zhì)譜碎片離子與鑒定實(shí)驗(yàn)的匹配性去掉在其他肉類出現(xiàn)的MRM離子對(duì),保留特異的MRM離子對(duì),并進(jìn)一步優(yōu)化DP、CE等質(zhì)譜參數(shù)。
最終確定的質(zhì)譜方法中,TurboVTM離子源參數(shù)為:gas1、gas2和氣簾氣為50psi,源溫度設(shè)為550℃,噴霧電壓為5500V。采用Scheduled MRMTM算法進(jìn)行檢測(cè):MRM檢測(cè)窗口設(shè)置為30秒,掃描時(shí)間設(shè)置為0.6秒。EPI掃描速度10000Da/s,掃描質(zhì)量范圍:250~1200Da,DP電壓50v,CE能量40±15V。
摻入最低定量檢測(cè)限LLOQ
將鴨肉和雞肉蛋白樣品按比例稀釋加入到羊肉蛋白樣品中,羊肉蛋白總量維持在2μg,以此確定鴨肉和雞肉摻入羊肉中的最低定量檢測(cè)限。用MultiquantTM軟件自動(dòng)積分并繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線并計(jì)算CV值和準(zhǔn)確度。
鴨和雞特征肽找尋
肉類鑒定的方法開發(fā)最關(guān)鍵的是找尋某一物種特征肽。眾所周知,一些物種親緣關(guān)系比較近,蛋白序列差別很小,比如雞和鴨、羊和牛等。還有一些物種的蛋白數(shù)據(jù)庫非常稀缺,比如鴨和羊,這樣找尋這些物種特征肽存在一定的難度,因此實(shí)驗(yàn)采用Triple TOFTM質(zhì)譜系統(tǒng)和Protein PilotTM軟件先鑒定這些物種肉樣品包含的蛋白質(zhì),充分利用Triple TOFTM質(zhì)譜系統(tǒng)強(qiáng)大的蛋白質(zhì)鑒定能力和Protein PilotTM軟件優(yōu)越的蛋白同源分析能力和物種分組能力。而且通過檢索NCBInr所有物種的蛋白庫,這樣很容易在Protein PilotTM軟件中確定一些物種同源的蛋白質(zhì)和肽,并且比較容易地找到某物種特異的肽,即使鴨或羊的數(shù)據(jù)庫不全,也可以通過Protein PilotTM軟件氨基酸替換檢索方式找到鴨的特征肽序列。最后在最全的蛋白數(shù)據(jù)庫NCBI網(wǎng)站做blast分析,進(jìn)一步確認(rèn)這些特征肽的物種特異性,將非特異的肽淘汰掉,保留特異肽。
筆者從某大型超市里隨機(jī)購買的羊肉卷里就鑒定出了大量的禽類來源蛋白質(zhì),由于鴨蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫不全,加上鴨和雞親緣關(guān)系比較接近,所以顯示的蛋白來源物種基本是原雞,這已經(jīng)提示這些羊肉卷里確實(shí)摻入了某種禽類肉,但無法確定具體是摻入什么肉。通過尋找的特征構(gòu)建的MRM方法檢測(cè)最終顯示這些羊肉卷里主要摻入了鴨肉而非雞肉,這就表明MRM方法比蛋白鑒定方法結(jié)果特異性更好,所以最終確定開發(fā)MRM檢測(cè)方法。
MIDASTM工作流程確認(rèn)特征
MRM離子對(duì)
AB SCIEX QTRAP®系列質(zhì)譜最大的優(yōu)勢(shì)是將串聯(lián)四級(jí)桿的高選擇性MRM掃描和離子阱高靈敏度的碎片離子掃描即EPI組合在一起,從而可以實(shí)現(xiàn)MIDASTM工作流程,這樣MRM峰可以得到二級(jí)圖譜的進(jìn)一步確認(rèn),有效消除假陽性的MRM峰。比如在用雞的特征MRM方法分析兔肉樣品時(shí),在15.5分鐘出現(xiàn)很明顯的MRM峰,但其觸發(fā)的二級(jí)圖譜去做圖庫檢索發(fā)現(xiàn)此MRM峰匹配到另外一個(gè)肽并不是設(shè)定的雞的特征肽。這說明單純的MRM峰并不一定能判定兔肉中有雞肉成分,需要MSMS圖譜進(jìn)一步確認(rèn)。
鴨肉和雞肉的最終特征
MRM檢測(cè)方法的確立

通過以上流程,確定雞的特征MRM檢測(cè)方法在純鴨肉、純羊肉、純牛肉、純豬肉、純兔肉和純大鼠肉樣品中都沒有檢測(cè)出相應(yīng)的MRM峰,在純鴨肉樣品中檢測(cè)出強(qiáng)度很高的MRM峰,證明了該方法的專一性和可靠性。同樣在超市購買的假羊肉卷里沒有檢測(cè)到雞的特征MRM峰,證明此羊肉卷里沒有摻入雞肉。
羊肉中摻入鴨肉和雞肉最低
定量檢測(cè)限
通過人為方法將鴨肉和雞肉蛋白按比例依次稀釋加入到2μg的羊肉蛋白里,用最終確定的鴨肉特征MRM方法和雞肉特征MRM方法來確定最低定量檢測(cè)限,鴨肉和雞肉蛋白從2μg開始摻入,每個(gè)稀釋重復(fù)3次。最終確定鴨肉最低定量檢測(cè)限可以達(dá)到 4ng,最低摻入比例為0.2%,從4~2000ng呈現(xiàn)良好的定量線性。雞肉最低定量檢測(cè)限達(dá)到20ng,最低摻入比例為1%,從20~2000ng呈現(xiàn)良好的定量線性。定量重現(xiàn)性良好,在最低濃度條件下,CV在5%以內(nèi)。這樣的最低定量檢測(cè)限和最低參入比例完全可以滿足日常的肉商檢測(cè)的需要。并可以非常容易地以此標(biāo)準(zhǔn)曲線測(cè)得假羊肉里摻入鴨肉或雞肉的比例和摻入的絕對(duì)量。
液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)為肉類物種來源檢測(cè)提供了一種快速、穩(wěn)定、靈敏、特異的方法,本方法的靈敏度可以媲美任何現(xiàn)有的ELISA方法或PCR方法。而且液質(zhì)聯(lián)用的方法可以同時(shí)檢測(cè)多種生物物種,遠(yuǎn)遠(yuǎn)好于ELISA每次只能分別檢測(cè)某種生物。使用MIDAS™工作流程可以在定量的同時(shí),進(jìn)行QTRAP®二級(jí)全掃描獲得定性確認(rèn)信息,與其他檢測(cè)方式相比大大減少了假陽性的概率。
本文給出了肉類物種來源分析的一種通用流程,即用AB SCIEX TripleTOFTM系列快速采集質(zhì)譜系統(tǒng)和ProteinPilotTM軟件鑒定各個(gè)物種蛋白質(zhì),然后分析找到某些物種的特征肽,再進(jìn)行blast分析篩選確定特征肽,然后轉(zhuǎn)到AB SCIEX QTRAP?質(zhì)譜系統(tǒng)上進(jìn)行MIDASTM流程,確定最終的特征肽MRM檢測(cè)方法。
本文建立了鴨肉和雞肉物種來源檢測(cè)的MRM方法,實(shí)驗(yàn)表明此方法具有很高的靈敏度、特異性、重現(xiàn)性和極低的線性定量檢測(cè)限,并且在市場(chǎng)上出售的假羊肉卷樣品中得到實(shí)際應(yīng)用,也表明此方法完全可以應(yīng)用在日常的羊肉卷摻入鴨肉或雞肉的實(shí)際檢測(cè)中。最終可以通過繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線很容易計(jì)算出在羊肉卷里摻入的鴨肉和雞肉比例和絕對(duì)量。
本文建立的MRM檢測(cè)方法簡(jiǎn)單易用,不需要再進(jìn)行復(fù)雜繁瑣的方法開發(fā)過程,可以直接用來檢測(cè)羊肉中摻入的鴨肉和雞肉,并且該方法的通量高,具有很好的擴(kuò)充性,可以方便加入新的需要監(jiān)測(cè)的物種MRM離子對(duì),一個(gè)方法里可以同時(shí)檢測(cè)多個(gè)物種。

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